W niedalekiej przyszłości wszystkie maszyny świata, zasilane i kierowane przez Wielką Machinę, zwracają się przeciwko ich użytkownikom i wywołują przewrót, w którego wyniku ludzkość zostanie zdziesiątkowana. W ostatnich dniach przed katastrofą tajemniczy naukowiec powołuje do życia grupę niewielkich szmacianych laleczek, które przetrwają apokalipsę. Jeden z nich, tytułowe Dziewięć (Elijah Wood) przejawia talenty przywódcze, pozwalające zebrać wokół niego pozostałych, małych wojowników. W skład niesfornej, acz niezwykle dzielnej bandy wchodzą: Jeden (Christopher Plummer) – apodyktyczny weteran i dotychczasowy przywódca stworów, Dwa (Martin Landau) – dobrotliwy, ale już leciwy wynalazca, Trzy i Cztery – uczone bliźniaczki, które porozumiewają się bez słów, Pięć (John C.Reilly) – troskliwy i nieustraszony inżynier, Sześć (Crispin Glover) – szalony artysta, którego bezustannie prześladują wizje, Siedem (Jennifer Connelly) – odważna, samodzielna wojowniczka i Osiem (Fred Tatasciore) - niezbyt lotny ochroniarz Jedynki.Ta nietypowa miniaturowa armia musi za sprawą tytułowego bohatera wznieść się ponad drobne spory i swoje ograniczenia, aby przechytrzyć i zwyciężyć wszechwładne maszyny, a zwłaszcza potężną bestię, grasującą na zgliszczach metropolii.
